藏医药学已有4000多年的历史，它对人体的认识要比现代西方医学早800年。
传说藏医药是药王菩萨所传授。药王菩萨又叫蓝琉璃佛，全身透明发蓝光，他端坐在药王城无量宫中的莲花宝座上讲经。他的周围簇拥着众天神、众仙人，还有佛教信徒以及非佛教徒，即外道徒。这些众人都是来聆听药王琉璃光佛讲解和传授医道的。
而药王讲解医学的药王城，四周有四座大山，都布满用于疗病的圣药。南面山上长满辛辣酸咸药，如胡椒、石榴、荜茇，用于治疗寒性病；北面山上则是苦涩味药，如冰片、檀香等，用于治疗热性病；东面山上，芳香药如诃子，种类甚多，性味也各不同，分别用于治疗骨、肉、筋、脉、脏、腑之疾病；西面的山上则有各种珍宝药，像五灵脂、鸟类、兽类，一切妙药一应俱全。整个药王城看起来氤氲缭绕，药香四溢，就像一座巨大的医药学宝库。藏医药学就是在这产生的。
走出神话，翻开尘封的历史，我们不难看到，远古时代生活在青藏高原的藏族先民们，就在同大自然的斗争中认识到了一些植物的治疗作用；在狩猎过程中，又逐渐知道了一些动物的药理作用。相传在公元前三世纪，就有了“有毒就有药”的说法。在随后的发展中，藏医学博采中医学、古印度医学、古阿拉伯医学之长，形成了独具特色的医学体系。
凭借博大精深的医药文化、系统完整的医学理论、得天独厚的药物资源、神奇多样的炮制工艺、堪称珍宝的成药系列，藏医学成为了世界传统医学中不可或缺的一部分。尤其值得称道的是，藏医药在治疗心脑血管、肝胆、神经系统、消化系统、免疫系统、泌尿生殖系统、妇科等疾病方面具有独特显著的疗效，受到世界医学界的关注。